在陰暗、遮光的室內或保護地內用磚砌成100-120厘米寬、20厘米深的種植槽。在槽底部鋪上塑料薄膜，在薄膜上間隔打洞，以便排出多余水分。用蛭石、珍珠巖、河沙等做基質。
選用子粒飽滿、色澤明亮、臍白、發芽率在95%以上的新種子。剔除不飽滿、破殘、蟲蛀豆粒及其雜質，用清水淘洗，漂去癟粒，洗凈種子。
將種子浸入20℃左右的清水中16-24小時，且換水4次。浸種結束后，洗去黏液和污物，用濕布包好催芽，種子露白時即可培育。
基質厚度為10厘米，澆透底水。再把催好芽的種子播在上面，每平方米播2公斤左右，上覆05厘米厚的基質。用細眼噴壺濺水，然后蓋上塑料薄膜。出苗前一般不再澆水。兩天后紅豆芽頂出基質，即揭去薄膜。
溫度應保持在16℃-30℃。每天澆水2-3次。水既要澆勻澆透，又不要積水。要保持場所的空氣清新。
當紅豆芽苗高15厘米、第一對真葉尚未完全展開、組織柔嫩、未纖維化時，沿莖基部剪切下來即可。
